남극대륙에 떨어진 거대한 운석과 지구에 나타난 수수께끼의 생명체 ‘새비지’ 때문에 인류는 역사상 최대 위기에 처한다. 새비지에 대항할 수 있는 유일한 무기는 ‘헌드레드’. 키사라기 하야토는 바로 그 헌드레드를 사용하는 ‘무예자(슬레이어)’가 되는 것을 목표로 해상 학원 도시함 ‘리틀가든’에 입학한다. 어찌된 영문인지 자신에 대해 자세히 알고(?) 있는 룸메이트 에밀 크로스포드에게 낯익은 위화감을 느끼는 하야토. 알고 보니 그는 역대 최고의 헌드레드 반응 수치를 기록한 신입생이었던 것!!! 하야토는 입학하자마자 학원 최강의 무예자인 ‘여왕’ 클레어 하베이의 결투 신청을 받게 되는데?!